Briskrabbamein er eitt banvænasta æxli í heimi og horfur eru slæmar. Þess vegna er þörf á nákvæmu spálíkani til að bera kennsl á sjúklinga í mikilli hættu á briskrabbameini til að sníða meðferð að þörfum þeirra og bæta horfur þeirra.
Við fengum RNAseq gögn úr The Cancer Genome Atlas (TCGA) fyrir briskirtilkrabbamein (PAAD) úr UCSC Xena gagnagrunninum, greindum ónæmistengd lncRNA (irlncRNA) með fylgnigreiningu og greindum mun á TCGA og eðlilegum briskirtilkrabbameinsvef. DEirlncRNA) úr TCGA og erfðafræðilegri tjáningu (GTEx) brisvefs. Frekari einvíðri og lassó aðhvarfsgreiningum var framkvæmd til að smíða spálíkön. Við reiknuðum síðan flatarmálið undir ferlinum og ákvörðuðum besta viðmiðunargildið til að bera kennsl á sjúklinga með há- og lágáhættu briskirtilkrabbamein. Til að bera saman klínísk einkenni, ónæmisfrumuíferð, ónæmisbælandi örumhverfi og krabbameinslyfjaónæmi hjá sjúklingum með há- og lágáhættu briskrabbamein.
Við greindum 20 DEirlncRNA pör og flokkuðum sjúklinga eftir bestu mögulegu viðmiðunarmörkum. Við sýndum fram á að spálíkan okkar hefur marktæka frammistöðu í að spá fyrir um horfur sjúklinga með PAAD. AUC ROC-kúrfunnar er 0,905 fyrir eins árs spá, 0,942 fyrir tveggja ára spá og 0,966 fyrir þriggja ára spá. Sjúklingar í mikilli áhættu höfðu lægri lifunartíðni og verri klínísk einkenni. Við sýndum einnig fram á að sjúklingar í mikilli áhættu eru með ónæmisbæld og geta þróað með sér ónæmi fyrir ónæmismeðferð. Mat á krabbameinslyfjum eins og paklítaxeli, sorafenibi og erlótíníbi byggt á tölvuspátækjum gæti verið viðeigandi fyrir sjúklinga í mikilli áhættu með PAAD.
Í heildina kom rannsókn okkar á fót nýju spálíkani byggðu á paraðri irlncRNA, sem sýndi lofandi spágildi hjá sjúklingum með briskrabbamein. Spálíkan okkar gæti hjálpað til við að greina á milli sjúklinga með briskrabbamein sem henta fyrir lyfjameðferð.
Briskrabbamein er illkynja æxli með lága fimm ára lifunartíðni og hátt stig. Þegar sjúkdómurinn greinist eru flestir sjúklingar þegar komnir á langt genginn stig. Í ljósi COVID-19 faraldursins eru læknar og hjúkrunarfræðingar undir miklu álagi þegar þeir meðhöndla sjúklinga með briskrabbamein og fjölskyldur sjúklinga standa einnig frammi fyrir margvíslegum þrýstingi þegar þeir taka ákvarðanir um meðferð [1, 2]. Þó að miklar framfarir hafi orðið í meðferð briskrabbameins, svo sem formeðferð, skurðaðgerð, geislameðferð, krabbameinslyfjameðferð, markvissri sameindameðferð og ónæmiseftirlitshemlar (ICI), lifa aðeins um 9% sjúklinga fimm ár eftir greiningu [3], 4]. Þar sem fyrstu einkenni briskirtilkrabbameins eru ódæmigerð eru sjúklingar venjulega greindir með meinvörp á langt gengnu stigi [5]. Þess vegna verður einstaklingsbundin alhliða meðferð fyrir tiltekinn sjúkling að vega og meta kosti og galla allra meðferðarúrræða, ekki aðeins til að lengja lifun heldur einnig til að bæta lífsgæði [6]. Þess vegna er nauðsynlegt að nota árangursríkt spálíkan til að meta horfur sjúklings nákvæmlega [7]. Þannig er hægt að velja viðeigandi meðferð til að vega og meta lifun og lífsgæði sjúklinga með PAAD.
Slæmar horfur briskrabbameins eru aðallega vegna ónæmis fyrir krabbameinslyfjum. Á undanförnum árum hafa ónæmisstöðvunarhemlar verið mikið notaðir við meðferð á föstum æxlum [8]. Hins vegar er notkun ICI (Inhibitors of Inferior Injury) við briskrabbameini sjaldgæf [9]. Þess vegna er mikilvægt að bera kennsl á sjúklinga sem gætu notið góðs af ICI meðferð.
Langt ókóðandi RNA (lncRNA) er tegund ókóðandi RNA með umritum >200 núkleótíðum. LncRNA eru útbreidd og mynda um 80% af umriti manna [10]. Mikil rannsókn hefur sýnt að spálíkön byggð á lncRNA geta á áhrifaríkan hátt spáð fyrir um horfur sjúklinga [11, 12]. Til dæmis voru 18 sjálfsáttengd lncRNA greind sem mynda spáeinkenni í brjóstakrabbameini [13]. Sex önnur ónæmistengd lncRNA hafa verið notuð til að ákvarða spáeinkenni glioma [14].
Í briskrabbameini hafa sumar rannsóknir sýnt fram á lncRNA-byggðar undirskriftir til að spá fyrir um horfur sjúklinga. 3-lncRNA undirskrift var staðfest í briskirtilkrabbameini með flatarmáli undir ROC-ferlinum (AUC) aðeins 0,742 og heildarlifun (OS) 3 ár [15]. Að auki eru lncRNA tjáningargildi mismunandi eftir mismunandi erfðamengjum, mismunandi gagnasniðum og mismunandi sjúklingum, og frammistaða spálíkansins er óstöðug. Þess vegna notum við nýjan líkanareiknirit, pörun og ítrun, til að búa til ónæmistengda lncRNA (irlncRNA) undirskriftir til að búa til nákvæmara og stöðugra spálíkan [8].
Gögn um staðlaðar RNAseq-rannsóknir (FPKM) og gögn um klíníska briskrabbameins-TCGA og erfðafræðilega vefjatjáningu (GTEx) voru fengin úr UCSC XENA gagnagrunninum (https://xenabrowser.net/datapages/). GTF skrár voru fengnar úr Ensembl gagnagrunninum (http://asia.ensembl.org) og notaðar til að vinna út lncRNA tjáningarprófíla úr RNAseq. Við sóttum ónæmistengd gen úr ImmPort gagnagrunninum (http://www.immport.org) og greindum ónæmistengd lncRNA (irlncRNA) með fylgnigreiningu (p < 0,001, r > 0,4). Auðkenning á mismunandi tjáðum irlncRNA (DEirlncRNA) var gerð með því að krossa irlncRNA og mismunandi tjáð lncRNA fengin úr GEPIA2 gagnagrunninum (http://gepia2.cancer-pku.cn/#index) í TCGA-PAAD hópnum (|logFC| > 1 og FDR) <0,05).
Þessi aðferð hefur verið lýst áður [8]. Nánar tiltekið smíðum við X til að koma í stað pöruðu lncRNA A og lncRNA B. Þegar tjáningargildi lncRNA A er hærra en tjáningargildi lncRNA B, er X skilgreint sem 1, annars er X skilgreint sem 0. Þess vegna getum við fengið fylki með gildinu 0 eða –1. Lóðrétta ás fylkisins táknar hvert sýni og lárétta ás táknar hvert DEirlncRNA par með gildinu 0 eða 1.
Einvíðri aðhvarfsgreining og síðan lasso-aðhvarfsgreining var notuð til að skima fyrir spádómspörum DEirlncRNA. Lasso-aðhvarfsgreiningin notaði 10-falda krossprófun endurtekin 1000 sinnum (p < 0,05), með 1000 handahófskenndum áreitum í hverri keyrslu. Þegar tíðni hvers DEirlncRNA-pars fór yfir 100 sinnum í 1000 lotum voru DEirlncRNA-pör valin til að smíða spádómslíkan. Við notuðum síðan AUC-kúrfuna til að finna bestu mögulegu viðmiðunargildi til að flokka PAAD-sjúklinga í hópa með mikla og litla áhættu. AUC-gildi hvers líkans var einnig reiknað og teiknað sem kúrfa. Ef kúrfan nær hæsta punkti sem gefur til kynna hámarks AUC-gildi, stöðvast útreikningsferlið og líkanið er talið besti kosturinn. 1-, 3- og 5-ára ROC-kúrfulíkön voru smíðuð. Einvíðri og fjölvíðri aðhvarfsgreiningar voru notaðar til að kanna sjálfstæða spágildi spádómslíkansins.
Notið sjö verkfæri til að rannsaka íferðarhraða ónæmisfrumna, þar á meðal XCELL, TIMER, QUANTISEQ, MCPCOUNTER, EPIC, CIBERSORT-ABS og CIBERSORT. Gögn um íferð ónæmisfrumna voru sótt úr TIMER2 gagnagrunninum (http://timer.comp-genomics.org/#tab-5817-3). Munurinn á innihaldi ónæmisfrumna milli hópa með mikla og litla áhættu í smíðaða líkaninu var greindur með Wilcoxon signed-rank prófinu, niðurstöðurnar eru sýndar á ferhyrningslaga grafi. Spearman fylgnigreining var framkvæmd til að greina sambandið milli áhættustiga og ónæmisfrumna. Niðurstöðufylgnistuðullinn er sýndur sem sleikjó. Marktækniþröskuldurinn var stilltur á p < 0,05. Aðferðin var framkvæmd með R pakkanum ggplot2. Til að kanna sambandið milli líkansins og genatjáningarstiga sem tengjast íferðarhraða ónæmisfrumna, framkvæmdum við ggstatsplot pakkann og sjónræna framsetningu á fiðlu.
Til að meta klínísk meðferðarmynstur við briskrabbameini reiknuðum við IC50 algengustu krabbameinslyfja í TCGA-PAAD hópnum. Mismunur á helmingunarhemjandi styrk (IC50) milli hópa með mikla og litla áhættu var borinn saman með Wilcoxon signed-rank prófinu og niðurstöðurnar eru sýndar sem kassarit búin til með pRRophetic og ggplot2 í R. Allar aðferðir eru í samræmi við viðeigandi leiðbeiningar og staðla.
Vinnuflæði rannsóknarinnar er sýnt á mynd 1. Með því að nota fylgnigreiningu milli lncRNA og ónæmistengdra gena völdum við 724 irlncRNA með p < 0,01 og r > 0,4. Næst greindum við mismunandi tjáð lncRNA í GEPIA2 (mynd 2A). Alls voru 223 irlncRNA mismunandi tjáð milli briskirtilkrabbameins og eðlilegs brisvefs (|logFC| > 1, FDR < 0,05), sem kölluð voru DEirlncRNA.
Smíði spálíkana fyrir áhættu. (A) Eldfjallamynd af mismunandi tjáðum lncRNA. (B) Dreifing lasso-stuðla fyrir 20 DEirlncRNA pör. (C) Hlutlæg líkindadreifni LASSO-stuðladreifingarinnar. (D) Skógarmynd sem sýnir einvíðri aðhvarfsgreiningu á 20 DEirlncRNA pörum.
Við smíðuðum næst 0 eða 1 fylki með því að para saman 223 DEirlncRNA. Alls voru 13.687 DEirlncRNA pör greind. Eftir einvíðri og lasso aðhvarfsgreiningu voru 20 DEirlncRNA pör að lokum prófuð til að smíða spálíkan fyrir áhættu (Mynd 2B-D). Byggt á niðurstöðum lasso- og margfeldis aðhvarfsgreiningar reiknuðum við áhættustig fyrir hvern sjúkling í TCGA-PAAD hópnum (Tafla 1). Byggt á niðurstöðum lasso aðhvarfsgreiningar reiknuðum við áhættustig fyrir hvern sjúkling í TCGA-PAAD hópnum. AUC ROC ferilsins var 0,905 fyrir spálíkanið fyrir 1 ár, 0,942 fyrir spálíkanið fyrir 2 ár og 0,966 fyrir spálíkanið fyrir 3 ár (Mynd 3A-B). Við settum kjörviðmiðunargildi upp á 3,105, skiptum sjúklingum í TCGA-PAAD hópnum í hópa með mikla og litla áhættu og teiknuðum upp lifunarniðurstöður og dreifingu áhættustiga fyrir hvern sjúkling (Mynd 3C-E). Kaplan-Meier greining sýndi að lifun PAAD sjúklinga í hópnum með mikla áhættu var marktækt lægri en sjúklinga í hópnum með litla áhættu (p < 0,001) (Mynd 3F).
Gildi spálíkana fyrir áhættu. (A) ROC spálíkansins fyrir áhættu. (B) 1-, 2- og 3-ára ROC spálíkön fyrir áhættu. (C) ROC spálíkans fyrir áhættu. Sýnir bestu viðmiðunarmörk. (DE) Dreifing lifunarstöðu (D) og áhættustiga (E). (F) Kaplan-Meier greining á sjúklingum með PAAD í hópum með mikla og litla áhættu.
Við metum frekar muninn á áhættustigum eftir klínískum einkennum. Ræmumyndin (mynd 4A) sýnir heildarsambandið milli klínískra einkenna og áhættustiga. Einkum höfðu eldri sjúklingar hærri áhættustig (mynd 4B). Að auki höfðu sjúklingar með stig II hærri áhættustig en sjúklingar með stig I (mynd 4C). Hvað varðar æxlisgráðu hjá sjúklingum með PAAD, þá höfðu sjúklingar með stig 3 hærri áhættustig en sjúklingar með stig 1 og 2 (mynd 4D). Við framkvæmdum einnig einvíðri og fjölvíðri aðhvarfsgreiningu og sýndum fram á að áhættustig (p < 0,001) og aldur (p = 0,045) voru óháðir spáþættir hjá sjúklingum með PAAD (mynd 5A-B). ROC-kúrvan sýndi að áhættustigið var betra en önnur klínísk einkenni við að spá fyrir um 1-, 2- og 3-ára lifun sjúklinga með PAAD (mynd 5C-E).
Klínísk einkenni spálíkana fyrir horfur. Súlurit (A) sýnir (B) aldur, (C) æxlisstig, (D) æxlisgráðu, áhættustig og kyn sjúklinga í TCGA-PAAD hópnum. **p < 0,01
Óháð spágreining á spálíkönum fyrir áhættu. (AB) Einvíddar (A) og fjölvíddar (B) aðhvarfsgreining á spálíkönum fyrir áhættu og klínískum einkennum. (CE) 1-, 2- og 3-ára ROC fyrir spálíkön fyrir áhættu og klínísk einkenni.
Þess vegna skoðuðum við tengslin milli tíma og áhættustiga. Við komumst að því að áhættustig hjá sjúklingum með PAAD var í öfugu fylgni við CD8+ T-frumur og NK-frumur (Mynd 6A), sem bendir til bælingar á ónæmisstarfsemi í hópnum með mikla áhættu. Við metum einnig muninn á íferð ónæmisfrumna milli hópanna með mikla og litla áhættu og fundum sömu niðurstöður (Mynd 7). Minni íferð var á CD8+ T-frumum og NK-frumum í hópnum með mikla áhættu. Á undanförnum árum hafa ónæmiseftirlitshemlar (ICIs) verið mikið notaðir við meðferð á föstum æxlum. Hins vegar hefur notkun ICI í briskrabbameini sjaldan borið árangur. Þess vegna metum við tjáningu ónæmiseftirlitsgena í hópum með mikla og litla áhættu. Við komumst að því að CTLA-4 og CD161 (KLRB1) voru ofurtjáð í hópnum með litla áhættu (Mynd 6B-G), sem bendir til þess að sjúklingar með PAAD í hópnum með litla áhættu gætu verið viðkvæmir fyrir ICI.
Fylgnigreining á spálíkani fyrir horfur og íferð ónæmisfrumna. (A) Fylgni milli spálíkans fyrir horfur og íferð ónæmisfrumna. (BG) Gefur til kynna genatjáningu í hópum með mikla og litla áhættu. (HK) IC50 gildi fyrir tiltekin krabbameinslyf í hópum með mikla og litla áhættu. *p < 0,05, **p < 0,01, ns = ekki marktækt
Við metum frekar tengslin milli áhættustiga og algengustu krabbameinslyfja í TCGA-PAAD hópnum. Við leituðum að algengum krabbameinslyfjum við briskrabbameini og greindum mun á IC50 gildum þeirra milli hópa með mikla og litla áhættu. Niðurstöðurnar sýndu að IC50 gildi AZD.2281 (olaparib) var hærra í hópnum með mikla áhættu, sem bendir til þess að PAAD sjúklingar í hópnum með mikla áhættu gætu verið ónæmir fyrir AZD.2281 meðferð (Mynd 6H). Að auki voru IC50 gildi paklítaxels, sorafenibs og erlotinibs lægri í hópnum með mikla áhættu (Mynd 6I-K). Við greindum einnig 34 krabbameinslyf með hærri IC50 gildi í hópnum með mikla áhættu og 34 krabbameinslyf með lægri IC50 gildi í hópnum með mikla áhættu (Tafla 2).
Það er ekki hægt að neita því að lncRNA, mRNA og miRNA eru til víða og gegna lykilhlutverki í þróun krabbameins. Nóg er af sönnunargögnum sem styðja mikilvægt hlutverk mRNA eða miRNA í að spá fyrir um heildarlifun í nokkrum tegundum krabbameins. Án efa eru margar líkön fyrir spár einnig byggð á lncRNA. Til dæmis hafa rannsóknir Luo o.fl. sýnt að LINC01094 gegnir lykilhlutverki í frumufjölgun og meinvarpi briskirtilssjúklinga, og mikil tjáning LINC01094 bendir til lélegrar lifunar hjá briskrabbameinssjúklingum [16]. Rannsóknin sem Lin o.fl. kynntu hefur sýnt að lncRNA sem tengist ónæmi er tiltölulega minna rætt hvað varðar spá fyrir um heildarlifun krabbameinssjúklinga. Undanfarið hefur mikil vinna verið lögð áhersla á að byggja upp líkön fyrir spár um lifun krabbameinssjúklinga og þar með aðlaga meðferðaraðferðir [18, 19, 20]. Vaxandi viðurkenning er á mikilvægu hlutverki ónæmisfrumna í upphafi krabbameins, framvindu og svörun við meðferðum eins og krabbameinslyfjameðferð. Fjölmargar rannsóknir hafa staðfest að ónæmisfrumur sem síast inn í æxli gegna mikilvægu hlutverki í svörun við frumueyðandi krabbameinslyfjameðferð [21, 22, 23]. Örverufræðilegt ónæmisumhverfi æxlisins er mikilvægur þáttur í lifun æxlissjúklinga [24, 25]. Ónæmismeðferð, sérstaklega ICI-meðferð, er mikið notuð við meðferð á föstum æxlum [26]. Ónæmistengd gen eru mikið notuð til að smíða spálíkön fyrir horfur. Til dæmis, Su o.fl. Ónæmistengd spálíkan byggist á próteinkóðandi genum til að spá fyrir um horfur sjúklinga með krabbamein í eggjastokkum [27]. Ókóðandi gen eins og lncRNA eru einnig hentug til að smíða spálíkön fyrir horfur [28, 29, 30]. Luo o.fl. prófuðu fjögur ónæmistengd lncRNA og smíðuðu spálíkan fyrir áhættu á leghálskrabbameini [31]. Khan o.fl. Alls voru 32 umrit með mismunandi tjáningu greind og út frá þessu var komið á fót spálíkani með 5 marktækum umritum, sem var lagt til sem mjög ráðlagt tæki til að spá fyrir um bráða höfnun eftir nýrnaígræðslu sem staðfest var með vefjasýni [32].
Flest þessara líkana byggjast á genatjáningarstigum, annað hvort prótein-kóðandi genum eða genum sem ekki eru kóðandi. Hins vegar getur sama genið haft mismunandi tjáningargildi í mismunandi erfðamengjum, gagnasniðum og hjá mismunandi sjúklingum, sem leiðir til óstöðugra mats í spálíkönum. Í þessari rannsókn smíðuðum við skynsamlegt líkan með tveimur pörum af lncRNA, óháð nákvæmum tjáningargildum.
Í þessari rannsókn greindum við irlncRNA í fyrsta skipti með fylgnigreiningu við ónæmistengd gen. Við skimuðum 223 DEirlncRNA með blendingum við mismunandi tjáð lncRNA. Í öðru lagi smíðuðum við 0-eða-1 fylki byggt á birtri DEirlncRNA pörunaraðferð [31]. Við framkvæmdum síðan einvíðri og lasso aðhvarfsgreiningu til að bera kennsl á spádóma DEirlncRNA pör og smíða spálíkan fyrir áhættu. Við greindum frekar tengslin milli áhættustiga og klínískra einkenna hjá sjúklingum með PAAD. Við komumst að því að spálíkan okkar, sem sjálfstæður spáþáttur hjá sjúklingum með PAAD, getur á áhrifaríkan hátt greint á milli sjúklinga með háa einkunn og sjúklinga með lága einkunn og sjúklinga með háa einkunn og sjúklinga með lága einkunn. Að auki voru AUC gildi ROC ferilsins í spálíkaninu 0,905 fyrir 1 árs spá, 0,942 fyrir 2 ára spá og 0,966 fyrir 3 ára spá.
Rannsakendur greindu frá því að sjúklingar með hærri CD8+ T frumuinnferð voru næmari fyrir ICI meðferð [33]. Aukning á innihaldi frumueyðandi frumna, CD56 NK frumna, NK frumna og CD8+ T frumna í ónæmisörumhverfi æxlisins gæti verið ein af ástæðunum fyrir æxlisbælandi áhrifum [34]. Fyrri rannsóknir sýndu að hærra magn æxlisinnferðar CD4(+) T og CD8(+) T tengdist marktækt lengri lifun [35]. Léleg CD8 T frumuinnferð, lágt magn nýmótefnavaka og mjög ónæmisbælandi æxlisörumhverfi leiddi til skorts á svörun við ICI meðferð [36]. Við komumst að því að áhættustig tengdist neikvætt CD8+ T frumum og NK frumum, sem bendir til þess að sjúklingar með háa áhættustig gætu ekki hentað fyrir ICI meðferð og hafi verri horfur.
CD161 er merki um náttúrulegar drápsfrumur (NK). CD8+CD161+ CAR-umbreyttar T-frumur miðla aukinni æxlishemjandi virkni in vivo í HER2+ briskirtilsæxlisæxlislíkönum [37]. Ónæmiseftirlitshemlar miða á frumudrepandi T eitilfrumuprótein 4 (CTLA-4) og forritað frumudauðaprótein 1 (PD-1)/forritað frumudauðalígand 1 (PD-L1) ferla og hafa mikla möguleika á mörgum sviðum. Tjáning CTLA-4 og CD161 (KLRB1) er minni í hááhættuhópum, sem bendir enn frekar til þess að sjúklingar með hááhættustig gætu ekki verið gjaldgengir fyrir ICI meðferð. [38]
Til að finna meðferðarúrræði sem henta sjúklingum í mikilli áhættu greindum við ýmis krabbameinslyf og komumst að því að paklítaxel, sorafenib og erlótínib, sem eru mikið notuð hjá sjúklingum með briskirtilsæxli (PAAD), gætu hentað sjúklingum í mikilli áhættu með PAAD. [33]. Zhang o.fl. komust að því að stökkbreytingar í hvaða DNA-skaðaviðbragðsferli sem er (DDR) geta leitt til slæmrar horfur hjá sjúklingum með krabbamein í blöðruhálskirtli [39]. Rannsóknin á Olaparib meðferð við briskirtilskrabbameini (POLO) sýndi að viðhaldsmeðferð með olaparibi lengdi lifun án framgangs sjúkdómsins samanborið við lyfleysu eftir fyrsta meðferðarúrræði með platínu hjá sjúklingum með kirtilkrabbamein í brisi og stökkbreytingar í kímlínu BRCA1/2 [40]. Þetta veitir mikla bjartsýni á að meðferðarárangur muni batna verulega hjá þessum undirhópi sjúklinga. Í þessari rannsókn var IC50 gildi AZD.2281 (olaparib) hærra í hópnum í mikilli áhættu, sem bendir til þess að sjúklingar með PAAD í hópnum í mikilli áhættu gætu verið ónæmir fyrir meðferð með AZD.2281.
Spálíkönin í þessari rannsókn gefa góðar spániðurstöður, en þær byggjast á greiningarspám. Hvernig á að staðfesta þessar niðurstöður með klínískum gögnum er mikilvæg spurning. Ómskoðun með fínnálssog (EUS-FNA) hefur orðið ómissandi aðferð til að greina fastar og utan briskirtilsskemmdir með 85% næmi og 98% sértækni [41]. Tilkoma EUS fínnálssýnatöku (EUS-FNB) byggist aðallega á skynjuðum kostum fram yfir FNA, svo sem meiri greiningarnákvæmni, að fá sýni sem varðveita vefjafræðilega uppbyggingu og þannig mynda ónæmisvef sem er mikilvægur fyrir ákveðnar greiningar. Sérstök litun [42]. Kerfisbundin yfirferð á fræðiritum staðfesti að FNB nálar (sérstaklega 22G) sýna mesta skilvirkni við vefjasöfnun úr briskirtilsæxlum [43]. Klínískt séð eru aðeins fáir sjúklingar gjaldgengir fyrir róttæka skurðaðgerð og flestir sjúklingar eru með óskurðtæk æxli við fyrstu greiningu. Í klínískri starfsemi eru aðeins fáir sjúklingar hentugir fyrir róttæka skurðaðgerð vegna þess að flestir sjúklingar eru með óskurðtæk æxli við fyrstu greiningu. Eftir staðfestingu á meinafræðilegri niðurstöðu með EUS-FNB og öðrum aðferðum er venjulega valin stöðluð meðferð án skurðaðgerðar, svo sem krabbameinslyfjameðferð. Síðari rannsóknarverkefni okkar er að prófa spálíkan þessarar rannsóknar í skurðaðgerðar- og óskurðaðgerðarhópum með afturskyggnri greiningu.
Í heildina kom rannsókn okkar á fót nýju spálíkani byggðu á paraðri irlncRNA, sem sýndi lofandi spágildi hjá sjúklingum með briskrabbamein. Spálíkan okkar gæti hjálpað til við að greina á milli sjúklinga með briskrabbamein sem henta fyrir lyfjameðferð.
Gagnasöfnin sem notuð voru og greind í þessari rannsókn eru aðgengileg frá viðkomandi höfundi ef óskað er eftir þeim á sanngjarnan hátt.
Sui Wen, Gong X, Zhuang Y. Miðlunarhlutverk sjálfstrausts í tilfinningastjórnun neikvæðra tilfinninga á tímum COVID-19 heimsfaraldursins: þversniðsrannsókn. Int J Ment Health Nurs [tímaritsgrein]. 2021 06/01/2021;30(3):759–71.
Sui Wen, Gong X, Qiao X, Zhang L, Cheng J, Dong J, o.fl. Skoðanir fjölskyldumeðlima á valákvörðunartöku á gjörgæsludeildum: kerfisbundin endurskoðun. INT J NURS STUD [tímaritsgrein; umsögn]. 2023 01/01/2023;137:104391.
Vincent A, Herman J, Schulich R, Hruban RH, Goggins M. Briskrabbamein. Lancet. [Tímaritsgrein; rannsóknarstuðningur, NIH, utan skóla; rannsóknarstuðningur, stjórnvöld utan Bandaríkjanna; umsögn]. 2011 08/13/2011;378(9791):607–20.
Ilic M, Ilic I. Faraldsfræði briskrabbameins. World Journal of Gastroenterology. [Tímaritsgrein, umsögn]. 2016 28.11.2016;22(44):9694–705.
Liu X, Chen B, Chen J, Sun S. Nýtt tp53-tengt nomogram til að spá fyrir um heildarlifun hjá sjúklingum með briskrabbamein. BMC Cancer [tímaritsgrein]. 2021 31-03-2021;21(1):335.
Xian X, Zhu X, Chen Y, Huang B, Xiang W. Áhrif lausnamiðaðrar meðferðar á krabbameinstengda þreytu hjá sjúklingum með ristilkrabbamein sem fá krabbameinslyfjameðferð: slembiraðað samanburðarrannsókn. Krabbameinshjúkrunarfræðingur. [Tímaritsgrein; slembiraðað samanburðarrannsókn; rannsóknin er studd af stjórnvöldum utan Bandaríkjanna]. 2022 05/01/2022;45(3):E663–73.
Zhang Cheng, Zheng Wen, Lu Y, Shan L, Xu Dong, Pan Y, o.fl. Magn krabbameins- og fósturvísisvaka (CEA) eftir aðgerð spáir fyrir um útkomu eftir aðgerð á ristilkrabbameini hjá sjúklingum með eðlileg CEA gildi fyrir aðgerð. Rannsóknarmiðstöð þýðandi krabbameins. [Tímaritsgrein]. 2020 01.01.2020;9(1):111–8.
Hong Wen, Liang Li, Gu Yu, Qi Zi, Qiu Hua, Yang X, o.fl. Ónæmistengd lncRNA mynda nýjar einkennir og spá fyrir um ónæmislandslag lifrarfrumukrabbameins hjá mönnum. Mol Ther Nucleic acids [Tímaritsgrein]. 2020 2020-12-04;22:937 – 47.
Toffey RJ, Zhu Y., Schulich RD Ónæmismeðferð við briskrabbameini: hindranir og bylting. Ann Gastrointestinal Surgeon [Tímaritsgrein; umsögn]. 2018 07/01/2018;2(4):274–81.
Hull R, Mbita Z, Dlamini Z. Langar ókóðandi RNA sameindir (LncRNA), erfðamengi veiruæxla og frávik í splicing atburðum: meðferðarleg áhrif. AM J CANCER RES [tímaritsgrein; umsögn]. 2021 01/20/2021;11(3):866–83.
Wang J, Chen P, Zhang Y, Ding J, Yang Y, Li H. 11-Auðkenning á lncRNA undirskriftum sem tengjast horfum á krabbameini í legslímu. Afrek vísindanna [tímaritsgrein]. 2021 2021-01-01;104(1):311977089.
Jiang S, Ren H, Liu S, Lu Z, Xu A, Qin S, o.fl. Ítarleg greining á RNA-bindandi prótein horfurgenum og lyfjaframbjóðendum í papillary cell nýrnakrabbameini. pregen. [Tímaritsgrein]. 20.01.2021;12:627508.
Li X, Chen J, Yu Q, Huang X, Liu Z, Wang X, o.fl. Einkenni langra, ókóðandi RNA sem tengjast sjálfsáti spá fyrir um horfur brjóstakrabbameins. pregen. [Tímaritsgrein]. 20.01.2021;12:569318.
Zhou M, Zhang Z, Zhao X, Bao S, Cheng L, Sun J. Ónæmistengd sex lncRNA undirskrift bætir horfur í glioblastoma multiforme. MOL Neurobiology. [Tímaritsgrein]. 2018 01.05.2018;55(5):3684–97.
Wu B, Wang Q, Fei J, Bao Y, Wang X, Song Z, o.fl. Ný tri-lncRNA undirskrift spáir fyrir um lifun sjúklinga með briskrabbamein. REPRESENTATIVES OF ONKOL. [Tímaritsgrein]. 2018 12/01/2018;40(6):3427–37.
Luo C, Lin K, Hu C, Zhu X, Zhu J, Zhu Z. LINC01094 stuðlar að framgangi briskrabbameins með því að stjórna LIN28B tjáningu og PI3K/AKT boðleiðinni í gegnum svampkennt miR-577. Mol Therapeutics – Kjarnsýrur. 2021;26:523–35.
Lin J, Zhai X, Zou S, Xu Z, Zhang J, Jiang L, o.fl. Jákvæð afturvirkni milli lncRNA FLVCR1-AS1 og KLF10 gæti hamlað framgangi briskrabbameins í gegnum PTEN/AKT ferilinn. J EXP Clin Cancer Res. 2021;40(1).
Zhou X, Liu X, Zeng X, Wu D, Liu L. Auðkenning þrettán gena sem spá fyrir um heildarlifun í lifrarfrumukrabbameini. Biosci Rep [tímaritsgrein]. 2021 04/09/2021.
Birtingartími: 22. september 2023